Materials Studio 2017 R1 for Linux

应用介绍

Materials Studio是一款材料计算软件，它拥有强大的仿真模拟功能，可以进行量子、原子、中尺度、统计等等模拟仿真。

使用指南

  1. 先申请资源。

  2. 启动完毕后点击“控制台”进入终端。

    MS安装路径为/opt/app/ms/MaterialsStudio17.1。

    模块的路径为/opt/app/ms/MaterialsStudio17.1/etc。

DMol3

在MS Windows程序中准备好DMol3计算所需要的文件，通常为.input, .mdf, .car等为后缀名的文件。

在MS里设置好模型后，不要直接运行，点击Files->DMol3 Job Files->Save Files，在Project中会产生新的文件夹和文件。

file

save files

右键点击新文件，选择Open Containing Folder。

open containing folder

将生成的文件复制到平台用户目录下，此处以dmol3目录为例。

注意

由于DMol3计算所需的.car和.mdf文件是隐藏文件，因此需要在Windows“工具|文件夹选项”中选择“显示隐藏文件”。

打开“控制台”，进入刚才的目录，将刚刚复制的文件转换为UNIX格式：

cd ~/dmol3
dos2unix *.*

运行计算：

. /opt/app/ms/MaterialsStudio17.1/etc/DMol3/bin/RunDMol3.sh -np 4 seedname

注解

-np 4指定计算用CPU数为4，可以根据申请实例资源中CPU数进行修改。如果不指定，默认使用一个CPU进行计算。

seedname为计算作业名称，和拷贝的文件名称要一致，例如文件为C60.input，C60.mdf，C60.car，那么seedname就是C60。

常见问题

  1. 其他模块的运行方式和参数设定，可在MS帮助文档中搜索running Module in standalone mode。